生物工程学院为满足制药和食品行业企业对生产加工——质量检测——贮运营销管理三个关键环节人才的需要。培养学生专业知识和生产操作技能，能够在相应企业或者在政府有关管理部门从事生产、研发、检验、营销和管理工作，具有创新精神和创新能力的高端技能型专业人才为目标的重点专业学院。
生物工程学院现有专兼职“双师型”专业教师43人，其中正教授2人，副教授及高级工程师6人，讲师及工程师11人，聘请了校外12名专家企业高级工程师任兼职教师；设有食品加工技术、食品营养与检测、食品贮运与营销、生物制药技术、药品经营与管理、药品质量检测技术六个专业；校内建有食品加工实训基地（包括啤酒生产、焙烤食品生产，肉制品加工、乳制品加工、果蔬加工及饮料生产等5个实训室）、食品检验实训基地（包括食品质量安全检测与分析实训室、食品微生物检测与分析实训室）、制药实训基地（包括生物制药、中西药和生化药品制剂、天然药物提取等3个实训室18个实训单元）、药物分析实训基地（包括精密仪器检测、微生物检测、药理药效综合检测实训室），本学院所设各专业实验实训设备仪器、设施装备齐全并处于领先水平，可同时满足200人实验实训操作。
经过多年来教学实践和根据省级骨干院校及重点专业建设规划，针对行业、企业对人才质量的需求，以提高专业人才培养质量为引领，对所有专业人才培养方案进行重新修订和完善，并且整合了内容相近且重复率较高的课程，对个别课程做了实质性改革，使课程设置得到了优化，使课程设置更加贴近行业、企业对人才的需要。同时结合各专业特点和学生的学习状况，以实现培养学生高技能为目标，确定并实施项目导向、任务驱动、理实一体及工学结合的教学模式。规范了符合专业要求的教学内容、教学大纲、教学计划；在实践教学上结合校企合作采用项目管理；在考核评价机制上本着“多一把尺子，多一批人才”思想，采用多角度、多方位的综合考核评价方法，使教学质量、学生综合素质、毕业生就业质量不断提高，为食品、制药行业企业输送了一批又一批具有创新能力和创业精神的高端技能型人才。
